Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC3P51654 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC3P51654 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms