Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ABCC5-202ENST00000334444 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ARL3P36405 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms