Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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HOXA13P31271 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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HOXA13P31271 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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HOXA13P31271 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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HOXA13P31271 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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HOXA13P31271 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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HOXA13P31271 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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HOXA13P31271 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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HOXA13P31271 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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