Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP1P29466 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP1P29466 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP1P29466 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP1P29466 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP1P29466 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP1P29466 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP1P29466 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP1P29466 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP1P29466 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP1P29466 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP1P29466 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms