Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 UGT1A8-201ENST00000373450 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC008040.1-204ENST00000469301 1738 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 CD226-207ENST00000582621 1458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PF4P02776 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PF4P02776 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms