Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms