Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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