Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLVAPQ9BX97 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms