Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms