Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms