Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms