Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCR5P32302 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms