Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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