Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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