Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms