Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLIP4Q8N3C7 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CLIP4Q8N3C7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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