Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CCDC142Q17RM4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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