Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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E2F1Q01094 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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