Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP46P62068 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP46P62068 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP46P62068 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP46P62068 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP46P62068 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP46P62068 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP46P62068 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP46P62068 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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USP46P62068 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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USP46P62068 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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USP46P62068 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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USP46P62068 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP46P62068 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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