Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP4P49662 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms