Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CCNA2P20248 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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