Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLRF2D3W0D1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms