Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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LRIT1Q9P2V4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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