Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR2Q2VWA4 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKOR2Q2VWA4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms