Protein–RNA interactions for Protein: Q13489

BIRC3, Baculoviral IAP repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIRC3Q13489 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BIRC3Q13489 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms