Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TGFBR1P36897 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms