Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PDE4DIP-219ENST00000524974 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL3P36405 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms