Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms