Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMG5Q9UPR3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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