Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms