Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RIPPLY3P57055 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms