Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms