Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms