Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA5P28066 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA5P28066 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA5P28066 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA5P28066 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMA5P28066 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms