Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms