Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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