Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms