Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRTQ9BXP5 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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