Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms