Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC15Q0P6D6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms