Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NDPQ00604 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NDPQ00604 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NDPQ00604 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDPQ00604 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
NDPQ00604 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDPQ00604 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms