Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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