Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TPTEP56180 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TPTEP56180 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TPTEP56180 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TPTEP56180 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TPTEP56180 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TPTEP56180 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TPTEP56180 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TPTEP56180 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TPTEP56180 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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TPTEP56180 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TPTEP56180 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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