Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PIP4K2AP48426 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms