Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFNP31947 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms