Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.4 ms