Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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