Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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C4orf47A7E2U8 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C4orf47A7E2U8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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C4orf47A7E2U8 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C4orf47A7E2U8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C4orf47A7E2U8 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C4orf47A7E2U8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C4orf47A7E2U8 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C4orf47A7E2U8 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C4orf47A7E2U8 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C4orf47A7E2U8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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