Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AP4B1Q9Y6B7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms