Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C5Q9Y5Q8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C5Q9Y5Q8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C5Q9Y5Q8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C5Q9Y5Q8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C5Q9Y5Q8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C5Q9Y5Q8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C5Q9Y5Q8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms